Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRIG3Q6UXM1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms