Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms