Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms