Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms