Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms