Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms