Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms