Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms