Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms