Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms