Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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