Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRF1Q16656 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms