Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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DDB1Q16531 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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