Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms