Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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