Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PDK2Q15119 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PDK2Q15119 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PDK2Q15119 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PDK2Q15119 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PDK2Q15119 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PDK2Q15119 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PDK2Q15119 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK2Q15119 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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