Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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