Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMC2Q13753 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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