Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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