Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms