Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CUL3Q13618 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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