Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PEX6Q13608 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PEX6Q13608 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PEX6Q13608 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PEX6Q13608 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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