Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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