Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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