Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TROQ12816 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TROQ12816 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TROQ12816 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TROQ12816 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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