Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KCNMA1Q12791 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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