Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms