Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXM1Q08050 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms