Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms