Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms