Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHC1P78364 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms