Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms