Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRG3P56975 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms