Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms