Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP3P42574 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP3P42574 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms