Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms