Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC1P35052 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC1P35052 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC1P35052 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC1P35052 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC1P35052 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC1P35052 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPC1P35052 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms