Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms