Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD6P30203 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD6P30203 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD6P30203 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms