Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMBRP28336 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms