Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms