Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms