Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APCP25054 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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