Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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