Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms