Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms