Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms