Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms