Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms