Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB3O75112 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms